Général
Le porc domestique et le porc sauvage ou sanglier appartiennent tous deux à l’espèce Sus Scrofa. Le porc domestique est classé en Sus scrofa domestica et le sanglier le plus commun en Sus scrofa scrofa. Le porc domestique et le sanglier sont interféconds. Ils diffèrent par leur nombre de chromosomes : 36 pour le sanglier et 38 pour le porc domestique.
L’espèce porc a été domestiquée suite à la sédentarisation des hommes et à l’apparition de l’agriculture il y a environ 10000 ans. Le porc domestique est une espèce d’intérêt économique et biomédical. Il constitue un modèle en santé humaine de par l’existence de caractéristiques anatomiques et physiologiques comparables à celles de l’homme: structure de la peau, réponse à des régimes athérogènes, anatomie cardio-vasculaire, système urinaire, anatomie et fonctionnement du rein. Les propriétés anatomiques et physiologiques d’organes tels le foie, le pancréas, le rein et le cœur font du porc un animal reconnu d’intérêt pour la xénogreffe. L’anatomie gastro-intestinale du porc diffère de celle de l’homme mais les processus digestifs étant similaires, le porc est intéressant pour l’étude de pathologies digestives. Il existe des races de porcs miniatures (Yucatan, Hanford, Gottingen) précieuses dans des protocoles expérimentaux pour lesquels la taille des animaux de ferme serait un obstacle.
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- Sus scrofa domestica @EFOR
- Nom : Sus scrofa domestica pour le porc domestique et Sus scrofa scrofa pour le sanglier
- Classification phylogénétique : mammifères de la famille des Suidae
- Génome séquencé (Swine Genome Sequencing Consortium (SGSC) 2003; Groenen et al, 2012)
- Taille du génome : 2,7 Gb2n = 38 chromosomes
Reproduction
Outils
- Capacité d’élevage dans des conditions contrôlées Installations SPF (Specific Pathogen Free)
- Banques de grands fragments d’ADN (BACs)
- Transfections cellulaires
- Transgenèse
- Cartes physiques, génétiques, cytogénétiques, d’hybrides d’irradiation
- Puces d’expression pour des analyses transcriptomiques
- Génotypage : microsatellites, SNPs
- Puces 60K SNP disponibles
- Anticorps
Bases de données
Races de porc domestique :
http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_domestic_pig_breeds
Annotation EST et ADNc :
Pig expression data explorer : http://pede.dna.affrc.go.jp/
SIGENAE : http://www.sigenae.org/
Porcine Immunology and Nutrition database :
http://ars.usda.gov/Services/docs.htm?docid=6065
Recherches biomédicales chez le porc (2000) :
Infrastructures
- Unité virologie immunologie porcines (UVIP)
- https://www.anses.fr/fr/content/laboratoire-de-ploufragan-plouzan%C3%A9-niort
- Plouzané
- INRAE UMR 1331 - Toxalim
- https://www6.toulouse.inrae.fr/toxalim
- Toulouse
- UMR Physiologie de la Reproduction et des Comportements (INRA/CNRS/Université François Rabelais de Tours/Institut Français du Cheval et de l'Equitation)
- https://www6.val-de-loire.inrae.fr/physiologie_reproduction_comportements
- Nouzilly
- UMR 0892 VIM « Virologie et Immunologie Moléculaires » (INRAE / UVSQ)
- https://www6.jouy.inrae.fr/vim/Presentation-de-l-unite
- Jouy-en-Josas
- UMR Université-INRA 1282 - Infectiologie et Santé Publique (ISP)
- https://www6.val-de-loire.inrae.fr/infectiologie-santepublique
- Nouzilly
- UMR 1313 - Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI)
- https://www6.jouy.inrae.fr/gabi
- Jouy-en-Josas
Experts
- Claire ROGEL-GAILLARD
- claire.rogel-gaillard@jouy.inra.fr
- INRA/AgroParisTech, UMR1313, Laboratoire de Génétique Animale et Biologie Intégrative, équipe INRA-CEA Génétique Immunité Santé, Jouy-en-Josas
Bibliographie
- Articles
″Application of genetically modified and cloned pigs in translational research″, Matsunari H, Nagashima H. 2009. J Reprod Dev. 2009 55(3):225-30
″Design of a High Density SNP Genotyping Assay in the Pig Using SNPs Identified and Characterized by Next Generation Sequencing Technology.″, Ramos et al. 2009. PLoS ONE 4(8): e6524
″Nomenclature for factors of the SLA system, update 2008.″, Ho CS, Lunney JK, Ando A, Rogel-Gaillard C, Lee JH, Schook LB, Smith DM. 2009,. Tissue Antigens 73(4):307-15
″Advances in swine biomedical model genomics.″, Lunney JK. 2007. Int J Biol Sci 3: 179-184
″Creating porcine biomedical models through recombineering.″, Rogatcheva MM, Rund LA, Swanson KS, Marron BM, Beever JE, Counter CM, Schook LB. 2004. Comp Funct Genomics 5(3):262-7
″Swine Genome Sequencing Consortium (SGSC): A strategic roadmap for sequencing the pig genome.″, Schook LB, Beever JE, Rogers J, Humphray S, Archibald A, Chardon P, Milan D, Rohrer G, Eversole K. 2005. Comp Funct Genomics 6(4):251-5
″Clinical and histopathological characterization of cutaneous melanomas in the melanoblastoma-bearing Libechov minipig model.″, Vincent-Naulleau S, Le Chalony C, Leplat JJ, Bouet S, Bailly C, Spatz A, Vielh P, Avril MF, Tricaud Y, Gruand J, Horak V, Frelat G, Geffrotin C. 2004. Pigment Cell Res 17(1): 24-35
- Autres ressources
Animaux :
– Races de porcs domestiques : Génétique et Expérimentation en Productions Animales, INRA
– Lignée athérosclérose : Animaux présentant une athérosclérose spontanée, Génétique et Expérimentation en Productions Animales, INRA
– Lignée MeLiM : Animaux ayant une susceptibilité génétique au mélanome cutané, UMR1313 de Génétique Animale et Biologie Intégrative, INRA
– Miniporcs homozygotes pour l’haplotype dd du CMH : UR Infectiologie Animale et Santé Publique, INRA
Chirurgie expérimentale :
Unité de Physiologie, reproduction et comportement, INRA, Tours
Transplantations :
Plateforme de chirurgie du Magneraud
Banques de BACs :
– CRB GADIE, Jouy-en-Josas, France : Distribution de clones, criblage par PCR
– BACPAC resources center
USA puces SNPs :
PorcineSNP60 Genotyping BeadChip
Typage du CMH :
UMR1313, Laboratoire de Génétique Animale et Biologie Intégrative, équipe INRA-CEA Génétique Immunité Santé, INRA/AgroParisTech, Jouy-en-Josas
Panel d’hybrides d’irradiation (RH) :
IMPRH, INRA : Distribution du panel et outil de cartographie RH