Général
La petite roussette, Scyliorhinus canicula (S. canicula), est un requin de petite taille appelé communément saumonette. Elle est présente en abondance en Méditerranée et Atlantique Nord et Est. Son maintien en laboratoire est possible avec des infrastructures adaptées disponibles dans plusieurs stations marines en Europe, même si les temps de développement sont incompatibles avec un élevage proprement dit. Aujourd’hui, la petite roussette est l’espèce candidate pour devenir le modèle de référence du groupe des chondrichtyens (poissons cartilagineux), groupe frère des ostéichtyens (poissons osseux). Elle présente tous les grands caractères morphologiques des gnathostomes (membres pairs, dents vraies, ceintures scapulaires et pelviennes…). Elle présente aussi des caractéristiques physiologiques et des organes sensoriels complexes.
Son étude est d’un intérêt majeur pour la compréhension de l’origine et la diversification des gnathostomes, et plus généralement dans toute approche comparative systématique à l’échelle des gnathostomes. Il s’agit en particulier d’une espèce clé pour l’identification des caractères dérivés propres aux deux sous-groupes des ostéichtyens: les actinoptérygiens et les sarcoptérygiens. Les possibilités d’obtention d’embryons, la disponibilité d’approches fonctionnelles établies (traitements pharmacologiques in ovo) et les développements en cours (culture d’embryons, électroporation, applications de billes imprégénées) en font actuellement un organisme modèle incontournable chez les chondrichtyens.
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- Roussette @divetime.com
- Nom : Scyliorhinus canicula
- Classification phylogénétique : Chordé, Vertébré, Chondrichtyen, Galéomorphe, famille des Carcharhiniformes
- Le séquençage génomique fait aujourd’hui l’objet de plusieurs demandes soumises ou en cours de préparation (ANR, Génoscope ; coord. S. Mazan)
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Taille du génome : 3.34 milliards de paires de bases (estimation : D. Chassoux et S. Mazan, communications personnelles).
Nombre de gènes putatifs non déterminé en l’absence d’une séquence de génome. Les données disponibles montrent cependant :
(1) que les deux séries de polyploïdisation intervenues à l’origine des vertébrés ont précédé la radiation des gnathostomes ;
(2) qu’aucune indication de polyploïdisations supplémentaires (telles que celles intervenues chez les actinoptérygiens) n’a été obtenue. Ces caractéristiques font de la roussette un groupe externe idéal pour reconstruire le génome ancestral des gnathostomes et identifier les pertes et gains de gènes intervenus chez les grands groupes d’ostéichtyens.
Reproduction
Fécondation interne, espèce ovipare.
Pas de saisonnalité marquée, mais la fréquence des pontes présente un maximum entre mars et juin. Les pontes sont peu abondantes : 2 oeufs par femelle toutes les 2 à 3 semaines et ce, au pic des pontes.
Le cycle de vie long, les femelles atteignant la maturité sexuelle à l’âge de 6 à 8 ans. L’obtention d’embryons repose donc actuellement uniquement sur l’utilisation de reproducteurs issus des populations sauvages et maintenus en captivité.
Outils
- Banques de BACs et d’ESTs
- Approches moléculaires et fonctionnelles possibles : Hybridation in situ, immunohistochimie
- Traitements pharmacologiques in ovo
Bases de données
Collection d’ESTs interne pour l’instant, base de données de 250 000 ESTs embryonnaires,
collection de clones correspondants, consultable sur requête auprès de S. Mazan (UMR 7232, BIOM – Observatoire Océanologique de Banyuls sur mer).
Banque de BACS ordonnée, 200 000 clones, 150 kb de taille moyenne de fragment inséré.
Table de développement : la plus couramment utilisée est Ballard et al. 1993. J. Exp. Zoology 267 :318-336.
Infrastructures
- Service Mer et Observation de la Station Biologique de Roscoff - Laurent Lévèque
- Roscoff
Experts
- Laurent LEVEQUE
- modeles.biologiques@sb-roscoff.fr
- Station Biologique de Roscoff, Service Mer et Observation
Bibliographie
- Articles
« Towards a synthetic view of axis specification mechanisms in vertebrates: insights from the dogfish. », Coolen M., Menuet A., Mazan S., C R Biol., 2009
« Evolution of genetic networks underlying the emergence of thymopoiesis in vertebrates. », Bajoghli B. et al., Cell, 2009
« The dogfish Scyliorhinus canicula, a reference in jawed vertebrates. », Coolen, M., Cold Spring Harbor Press Chapter 21 pp 431-446., 2008
« A molecular analysis of neurogenic placode and cranial sensory ganglion development in the shark, Scyliorhinus canicula. », Guérin A. et al., PLoS One., 2009
« Cyclostome studies in the context of vertebrate evolution. », O’Neill P., McCole RB., Baker CV., Dev Biol., 2007
« Biphasic Hoxd gene expression in shark paired fins reveals an ancient origin of the distal limb domain. », Freitas R., Zhang G., Cohn MJ., PLoS One., 2007
« Evidence that mechanisms of fin development evolved in the midline of early vertebrates. », Freitas R., Zhang G., Cohn MJ., Nature, 2006