Général
Le rat est à ce jour l’espèce modèle de petite taille physiologiquement la plus proche de l’homme. Cette caractéristique, ainsi que les récentes avancées sur les manipulations génétiques, et la facilité des interventions chirurgicales du fait de sa grande taille (10 fois plus gros que la souris), font du rat un modèle très attractif. Il est couramment utilisé pour l’étude de nombreuses pathologies humaines, ainsi que pour la découverte de nouvelles cibles et molécules thérapeutiques.
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Reproduction
Période de reproduction: toute l’année
Temps de gestation : 21 à 23 jours
Sevrage physiologique : environ 4 semaines
Sevrage social : 5 à 6 semaines
Age de mise à la reproduction : mâles 5 à 7 semaines, femelles 4 à 10 semaines
Nombre de jeunes : 7 à 14 petits par portée(en moyenne)
Nombre de portées par an: 6 à 8
Outils
- Trois millions de SNPs identifiés entre différentes lignées de rats, plus de 800 000 ESTs et plus de 5000 séquences géniques annotées
- 20 000 SNPs identifiés sur 300 lignées isogéniques ont été sélectionnés pour caractériser de nombreux QTLs (Quantitative Traits Locus), et cartographier des gènes responsables de maladies
- Très large panel d’outils génétiques : lignées de rats consanguins, consomiques, congéniques, isogéniques, lignées mutantes obtenues par mutagenèse ENU, lignées modèles de maladies, etc
- Développement des technologies de transgenèse, ciblée ou non, notamment : transfert d’ADN via un vecteur viral, transfert génique à médiation spermatique, et RNAi
- Rats KO ciblés par utilisation de zinc finger nucleases. Récemment, il a été possible d’obtenir des cellules ES et il sera donc possible de générer des rats mutés à partir de celles-ci
- Diverses techniques d’exploration fonctionnelle de pointe
Bases de données
Rat Genome Database : http://rgd.mcw.edu/
Infrastructures
- Genoway
- https://genoway.com
- Lyon
- Transgenic Rats Immunophenomics (TRIP)
- http://www.itun.nantes.inserm.fr/Core-facilities/TRIP-Transgenic-Rats-ImmunoPhenomic
- Nantes
Experts
- Ignacio ANEGON
- IANEGON@nantes.inserm.fr
- Unité Inserm U643, Nantes
Bibliographie
- Articles
“Progress and prospects in rat genetics: a community view”, Aitman, Nature genetics, 2008
- Ressources web