Général
Une propriété fondamentale des Légumineuses, qui est largement responsable de leur intérêt agronomique, est leur aptitude à fixer l’azote par la symbiose avec Rhizobium (bactéries aérobies du sol), aptitude qui explique la forte teneur en protéines de ces plantes et qui permet cette synthèse de protéines sans avoir recours à une fertilisation azotée chimique.
Depuis quelques années, de nombreux laboratoires utilisent la luzerne tronquée, ou Medicago truncatula (M. truncatula) pour étudier divers aspects des interactions plantes-microorganismes. Le génome de M. truncatula présente une grande synténie avec les espèces de Légumineuses les plus cultivées en Europe, comme le pois ou la luzerne cultivée (M. sativa). C’est une espèce diploïde et son génome (sept fois plus petit que celui du pois) permet d’accéder rapidement aux séquences génomiques et de produire des mutants pour des analyses de génétique fonctionnelle. Le développement des recherches sur cette Légumineuse modèle fournira des outils importants pour la génétique et l’amélioration des Légumineuses cultivées, que ce soit pour la recherche fondamentale, ou dans le domaine de la recherche privée.
- Nom : Medicago truncatula
- Classification phylogénétique : plante de la famille des fabaceae
- Génome séquencé
- Taille du génome : 450 millions de paires de bases (3 à 4 fois supérieure à celle d’A. thaliana et équivalente à celle du riz) sur 8 chromosomes. Diploïde vrai. Nombre de gènes : environ 30 000
Reproduction
Période de reproduction : toute l’année en serre. Cycle de développement : environ 12 semaines.
La pollinisation est de type autogame: les fleurs sont bisexuées ou hermaphrodites (elles possèdent des organes mâles et femelles dans la même fleur) et la maturité des gamètes est simultanée.
Outils
- Collection de variants naturels et mutants induits
- Mutagenèse par la méthode de Tilling
- Mutagenèse insertionnelle (plus de 200 000 insertions dans M. truncatula ssp. tricycla R108)
- Transgenèse (via transformation par Agrobacterium tumefaciens et embryogenèse somatique)
- Invalidation de gènes par RNAi
- Analyses transcriptomiques
- Banques d’ESTs, de cDNA
Bases de données
Bases de données générales :
http://www.noble.org/MedicagoHandbook/
http://www.legoo.org/
Bases de données génomiques :
http://mips.gsf.de/proj/plant/jsf/medi/download/index.jsp
http://www.tigr.org/tdb/e2k1/mta1/
Banque de mutants d’insertion :
https://medicago-mutant.noble.org/mutant/index.php
Base de données de Tilling :
http://revgenuk.jic.ac.uk/
Infrastructures
- UMR Diversité, Adaptation, Développement des plantes (DIADE) -
- http://diade.ird.fr/
- Montpellier
- URP3F - Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères
- https://www6.nouvelle-aquitaine-poitiers.inrae.fr/urp3f
- Lusignan
- Laboratoire des Interactions Plantes Microorganismes (LIPM)
- https://www6.toulouse.inrae.fr/lipm
- Toulouse
- UMR Agronomie - INRAE/AgroParisTech/Université Paris-Saclay
- https://www6.versailles-grignon.inrae.fr/agronomie/
- Paris
Experts
- Pascal RATET
- Pascal.Ratet@isv.cnrs-gif.fr
- IPS2, Gif-sur-Yvette