Lamproie

Sylvie MAZAN
smazan@sb-roscoff.fr
UMR 7150, Station Biologique de Roscoff

Génomique
Genomics

Ecotoxicologie
Ecotoxicology

Biologie évolutive
Evolution

Equipe zoologie moléculaire
Institut de génomique fonctionnelle
Branchiostoma lanceolatum
http://igfl.ens-lyon.fr/les-equipes/equipe-6
Lyon

 

Equipe zoologie moléculaire
UMR 5242, Institut de génomique fonctionnelle de Lyon
Lamproie
http://igfl.ens-lyon.fr/equipes/v.-laudet-molecular-zoology
Lyon

 

Equipe Développement et évolution du cerveau antérieur
UPR 3294 NED Neurobiologie Et Développement
Lamproie
http://www.inaf.cnrs-gif.fr/ned/accueil.html
Gif-sur-Yvette
Sylvie Rétaux

 

Equipe Développement et évolution des systèmes neurosécréteurs
UMR 7221, CNRS-MNHN
Roussette, Lamproie
http://www.mnhn.fr/fr/rddm/usm501/index.php?option=com_content&view=article&id=4&Itemid=9&lang=fr

La lamproie marine, ou Petromyzon marinus (P. marinus), est un vertébré agnathe (dépourvu de mâchoires), appartenant au groupe des pétromyzontidés, qui regroupe moins de quarante espèces. Elle présente une corde, une bouche arrondie garnie de pointes, un squelette cartilagineux et des vertèbres rudimentaires. Sa morphologie générale rappelle celle de l’anguille (corps allongé dépourvu d’écailles), mais avec une taille nettement supérieure (70 cm-1 m). Cette espèce présente une distribution géographique large en Europe et en Amérique du Nord et son maintien en laboratoire pendant les périodes de ponte est aisé. Les pontes sont très abondantes mais saisonnières et les embryons peuvent être maintenus en laboratoire jusqu’au stade prolarve. Compte tenu de la complexité du cycle de vie (espèce migratrice) et de la durée des stades larvaires (plusieurs années), cette espèce ne fait actuellement l’objet d’aucun élevage. Elle est actuellement le modèle de référence chez les cyclostomes (myxines et lamproies), groupe frère des vertébrés à mâchoires. Cette position phylogénétique, en fait une espèce d’un intérêt majeur pour comprendre l’origine des vertébrés, et de façon plus générale, dans toute approche comparative systématique à l’échelle des vertébrés. Les approches fonctionnelles possibles chez cette espèce comprennent la perte de fonction de gènes via injection d’oligonucléotides antisens de type morpholinos et l’expression transitoire de gènes rapporteurs ou de vecteurs de surexpression

La fécondation est externe. Les pontes sont saisonnières et très abondantes puisqu’une femelle peut produire jusqu’à 10 000 œufs par ponte. Le temps de génération est assez long puisqu’il est de 6 à 7 ans. Les pontes ont lieu au printemps en milieu fluvial, à l’issue d’une migration des reproducteurs depuis les estuaires. Le développement inclut une phase embryonnaire (6 semaines) et une phase larvaire (5 ans), à l’issue de laquelle a lieu une métamorphose suivie d’un retour à la mer pour les animaux post-métamorphiques.

Petromyzon marinus

Classification phylogénétique : Chordé, Vertébré, Cyclostomes, Pétromyzontidés

Génome en cours de séquençage : couverture 5.9x-9.3x selon l’estimation de la taille du génome, assemblage préliminaire disponible sur le site Pre-Ensembl http://pre.ensembl.org/Petromyzon_marinus

Taille du génome non déterminé en l’absence d’un assemblage fiable, estimations allant de 1.3 à 2 milliards de paires de bases

Nombre de gènes putatifs non déterminé, génome en cours d’annotation

Banques de BACs et d’ESTs Approches moléculaires et fonctionnelles possibles : Hybridation in situ, immunohistochimie

Traitements pharmacologiques

Approches fonctionnelles de type perte de fonction (injection de morpholinos au stade 1 cellule)

Expression transitoire de gènes rapporteurs

Bases de données génomiques : http://www.pre.ensembl.org/Petromyzon_marinus

Banque d’ESTs :

Base de donnÈes de 150 000 ESTs embryonnaires, collection de clones correspondants, consultable sur requÍte auprËs de S. Mazan

Banque de BACs commercialisÈe par le CHORI :

http://www.bacpac.chori.org

Table de dÈveloppement :

La plus couramment utilisÈe est celle de Tahara Y. 1988. Zoological Science 5 :109-118 (table Ètablie pour Lampetra reissneri mais Ègalement valable pour P. marinus)

Articles :

The sea lamprey Petromyzon marinus genome reveals the early origin of several chemosensory receptor families in the vertebrate lineage. », Libants S. et al., BMC Evol Biol., 2009, (disponible http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2728731/?tool=pubmed)

« Dual nature of the adaptive immune system in lampreys. », Guo P. et al., Nature, 2009 (disponible http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2714547/?tool=pubmed)

« Modularity, comparative embryology and evo-devo: developmental dissection of evolving body plans. », Kuratani S., Dev Biol., 2009 (disponible http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0012160609008823)

« Neurodevelopment genes in lampreys reveal trends for forebrain evolution in craniates. », Guérin A. et al., PLoS One., 2009 (disponible http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2671401/?tool=pubmed)

« Cyclostome studies in the context of vertebrate evolution. », McCauley DW. et al., Zoolog Sci., 2008 (disponible http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19267629)

« Ancient evolutionary origin of the neural crest gene regulatory network. », Sauka-Spengler T. et al., Dev Cell., 2007 (disponible http://www.cell.com/developmental-cell/abstract/S1534-5807%2807%2900305-X)

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