Général
Arabidopsis thaliana (A. thaliana), est aussi appelée arabette de Thalius, arabette rameuse ou encore arabette des dames. Cette plante sert d’organisme modèle en sciences du végétal depuis plusieurs années, et est représentative des végétaux supérieurs chlorophylliens et vasculaires (Angiospermes dicotylédones). Le génome d’A. thaliana est l’un des plus petits du monde végétal et sa séquence a été déterminée en 2000. Cette plante est couramment utilisée pour des études génétiques et de biologie moléculaire.
Les intérêts de cet organisme pour la recherche végétale sont divers : sa petite taille permet de la cultiver en nombre, son cycle de développement est court et une plante peut produire des dizaines de milliers de graines.
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- Arabidopsis thaliana – @EFOR
- Nom : Arabidopsis thaliana
- Classification phylogénétique : angiosperme de la famille des Brassicacées
- Génome séquencé (2000)
- Taille du génome : 157 millions de paires de bases sur 5 chromosomes. Nombre de gènes : environ 27 000.
Reproduction
Période de reproduction: Toute l’année (printemps à l’état sauvage).
Cycle de Développement: le cycle de de graine à graine dure trois mois.
Les différents stades de développement d ’ A. thaliana sont décrits ici: http://www.arabidopsis.org/portals/education/growth.jsp
Sexualité : hermaphrodite.
Reproduction : principalement auto-fécondation (autogame)
Instructions pour la culture d ’ A. thaliana : http://www.hort.purdue.edu/hort/facilities/greenhouse/
Outils
- Collections de mutants d’insertion indépendants
- Collections d’écotypes (exploration de la variabilité génétique).
- Collections de clones (ADNc, BAC, TER)
- Cultures automatisées et phénotypages automatiques grâce a des robots : possibilité de cultiver de façon stéréotypée des milliers de plantes, de photographier ces plantes et d’en mesurer le poids, ou l’activité photosynthétique par exemple.
- Populations de lignées recombinantes (RIL) pour la recherche de QTL.
- Diverses techniques d’exploration fonctionnelle de pointe (Marqueurs sous-Cellulaires, Marqueurs hormonaux, développementaux, …).
Bases de données
Bases de Données génomiques
http://www.arabidopsis.org/
http://www.arabidopsis.org/portals/
http://arabidopsis.info/
Base de données sur microarrays :
http://arabidopsis.info/
Base référence sur les Cis-Acting Regulatory Elements :
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/
Infrastructures
- Plateforme de phytotechnologie (PHYTOTEC)
- http://biam.cea.fr/drf/biam/Pages/plateformes/phytotec.aspx
- Centre CEA de Cadarache, St Paul lez Durance
- Centre de ressources Arabidopsis thaliana - Observatoire du Végétal IJPB Versailles (OV-IJPB)
- https://www6.inrae.fr/saclay-plant-sciences/Infrastructures/Ressources-biologiques/Centre-de-Ressources-Arabidopsis-thaliana
- Versailles
Experts
- Christian MEYER
- meyer@versailles.inra.fr
- INRA, Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Versailles
Bibliographie
- Articles
″Plant biologists fear for cress project″, Heidi Ledford, Nature, 2010
- Ressources web