Général
Le corail rouge, Corallium rubrum, constitue une espèce emblématique des fonds sous-marins de Méditerranée. Cette espèce présente une grande importance écologique et économique, ce qui justifie les études génétiques réalisées chez cette espèce. Plusieurs événements de mortalités liés à des anomalies thermiques positives montrent qu’elle est affectée par le changement climatique en cours. Il est donc important de développer des études de génétique fonctionnelle chez cette espèce afin d’étudier sa réponse aux stress environnementaux. Par ailleurs, le corail rouge fait partie des cnidaires octocoralliaires, un groupe encore relativement peu étudié du point de vue de la génétique fonctionnelle : il constitue donc un modèle intéressant pour des approches comparatives et évolutives au sein des métazoaires.
Il est également un excellent modèle pour étudier la biominéralisation, processus dynamique et physiologique par lequel un organisme transforme des ions en solution en une structure composite, le biominéral. Le corail rouge a en effet la particularité d’élaborer deux biominéraux de structure et de taille très différentes : un squelette axial et des éléments plus ou moins dispersés appelés sclérites. L’outil transcriptomique couplé aux approches biochimiques permet de caractériser les gènes impliqués dans la biominéralisation et de réaliser des études comparatives intra et inter-espèces.
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- Corail rouge @Frédéric Zuberer
- Nom : Corallium rubrum
- Classification phylogénétique : cnidaire, octocoralliaire, de la famille des Coralliidae
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Transcriptome en cours de séquençage
(Pré-print disponible sur HAL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01445149)
Reproduction
Outils
- Le transcriptome est en cours de séquençage
- Divers marqueurs moléculaires sont disponibles (microsatellites, gènes nucléaires ou mitochondriaux) pour des analyses de diversité génétique ou d’expression de gènes par PCR en temps réel
Bases de données
Infrastructures
- Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale (IMBE) - UMR CNRS7263 IRD237 AMU UAPV - Equipe IDEA
- https://www.imbe.fr/
- Marseille
- Centre Scientifique de Monaco - Equipe physiologie/biochimie
- http://www.centrescientifique.mc/fr/
- Monaco
Experts
- Didier AURELLE
- didier.aurelle@univ-amu.fr
- UMR 7263 IMBE CNRS / AMU, Marseille
Bibliographie
- Articles
Génétique des populations : Plusieurs études ont été réalisées à l’aide de marqueurs microsatellites et d’introns. Elles soulignent l’importante structuration génétique de cette espèce.
« Phylogeography of the red coral (Corallium rubrum): inferences on the evolutionary history of a temperate gorgonian. », Aurelle et. al., Genetica, 2011
« Fine-scale genetic structure and inferences on population biology in the threatened Mediterranean red coral, Corallium rubrum », Ledoux et. al., Molecular Ecology, 2010
« Genetic survey of shallow populations of the Mediterranean red coral (Corallium rubrum (Linnaeus, 1758)): new insights into evolutionary processes shaping current nuclear diversity and implications for conservation », Ledoux et. al., Molecular Ecology, 2010
« Evaluation of the utility of COI and ITS markers as tools for population genetic studies of temperate gorgonians », Calderón et. al., Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2006
Biominéralisation : Plusieurs études ont été réalisées pour caractériser le squelette axial et les sclérites de cette espèce mettant en évidence que les molécules organiques de ces deux biominéraux présentent à la fois des points communs et des différences.
« Specific organic matrix characteristics in skeletons of Corallium species », Debreuil et. al., Marine Biology, 2011
« Comparative analysis of the soluble organic matrix of axial skeleton and sclerites of Corallium rubrum: Insights for biomineralization », Debreuil et. al., Comparative Biochemistry and Physiology B Biochemistry and Molecular Biology, 2011
« Determination of canthaxanthin in the red coral (Corallium rubrum) from Marseille by HPLC combined with UV and MS detection », Cvejic et. al., Marine Biology, 2007
« Dynamics of calcification in the Mediterranean red coral, Corallium rubrum (Linnaeus) (Cnidaria, Octocorallia) », Allemand et Bénazet-Tambutté, Journal of Experimental Zoology, 1996
« Skeleton formation in Mediterranean red coral Corallium rubrum », Grillo et. al., Marine Biology, 1993
« The biology and skeletogenesis of the Mediterranean Red coral. A review », Allemand, Precious Corals and Octocorals Research, 1993
« Biocalcification mechanism in gorgonians. 45Ca uptake and deposition by the mediterranean red coral Corallium rubrum », Allemand et Grillo, Journal of Experimental Zoology, 1992