Lucerne

Pascal RATET
Pascal.Ratet@isv.cnrs-gif.fr
ISV-CNRS, Gif-sur-Yvette

Physiologie végétale
Vegetal Physiology

Génomique

Genomics
 

Génétique

Genetics
 

Ecologie

Ecology
 

Biologie cellulaire et moléculaire

Cell & molecular biology
 

Adaptation du végétal à l’environnement
Plant adaptation to environment

Unité Mixte de Recherches en Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses à Graines UMRLEG
Medicago truncatula
http://www.dijon.inra.fr/
Dijon
Richard Thompson

 

Unité de Génomique Végétale
Tomate (Groupe « crop genomics »), Vigne
http://www.versailles-grignon.inra.fr/
Versailles

 

UMR APBV
http://w3.rennes.inra.fr/apbv/
Rennes

 

Ressources génétiques et amélioration de luzernes mditérranéennes Diversité et Adaptation des Plantes Cultivées (DIAPC)
UMR
Medicago truncatula, Vigne
Montpellier
Serge Hamon et Jean-Marie Prosperi

 

Recherche pluridisciplinaire prairies et plantes fourragères P3F
UR4
Medicago truncatula
http://www.poitou-charentes.inra.fr/
Poitou-Charentes

 

Physiologie Moléculaire des Semences
UMR 1191 (Université d’Angers/INH/INRA)
Medicago truncatula
http://www.angers-nantes.inra.fr/
Angers
Olivier Leprince et Anis Limami

 

Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes (LIPM)
Medicago truncatula
http://www.toulouse.inra.fr/
Toulouse
Pascal Gamas et David Barker

 

Institut des Sciences du Végétal, CNRS
UPR2355
Medicago truncatula
http://www.isv.cnrs-gif.fr/presentation/institut.html
Bordeaux

 

INA P-G d’Agronomie
UMR INRA
Medicago truncatula
http://www6.versailles-grignon.inra.fr/agronomie/
Versailles
Marie-Hélène Jeuffroy et Jean Roger-Estrade

 

centre de ressources biologiques
http://www1.montpellier.inra.fr/BRC-MTR/accueil.php
montpellier

 

Biologie Moléculaire des relations plantes-microorganismes
UMR 215 CNRS-INRA,
Medicago truncatula
http://medicago.toulouse.inra.fr/ATS/inratlse.html
Toulouse
Jean Dénarié

 

Agrocampus d’Amélioration des Plantes et Biotechnologies Végétales
UMR INRA
Medicago truncatula
http://www6.rennes.inra.fr/igepp
Rennes

Une propriété fondamentale des Légumineuses, qui est largement responsable de leur intérêt agronomique, est leur aptitude à fixer l’azote par la symbiose avec Rhizobium (bactéries aérobies du sol), aptitude qui explique la forte teneur en protéines de ces plantes et qui permet cette synthèse de protéines sans avoir recours à une fertilisation azotée chimique. Depuis quelques années, de nombreux laboratoires utilisent la luzerne tronquée, ou Medicago truncatula (M. truncatula) pour étudier divers aspects des interactions plantes-microorganismes. Le génome de M. truncatula présente une grande synténie avec les espèces de Légumineuses les plus cultivées en Europe, comme le pois ou la luzerne cultivée (M. sativa). C’est une espèce diploïde et son génome (sept fois plus petit que celui du pois) permet d’accéder rapidement aux séquences génomiques et de produire des mutants pour des analyses de génétique fonctionnelle. Le développement des recherches sur cette Légumineuse modèle fournira des outils importants pour la génétique et l’amélioration des Légumineuses cultivées, que ce soit pour la recherche fondamentale, ou dans le domaine de la recherche privée.

Période de reproduction : toute l’année en serre. Cycle de développement : environ 12 semaines.

La pollinisation est de type autogame: les fleurs sont bisexuées ou hermaphrodites (elles possèdent des organes mâles et femelles dans la même fleur) et la maturité des gamètes est simultanée.

Des protocoles résumés pour la culture de M. truncatula et pour la germination des graines sont disponibles aux adresses suivantes :

www.medicago.org/documents/Protocols/cultivate.html

www.medicago.org/documents/Protocols/seedgerm.html

Medicago truncatula Classification phylogénétique : légumineuse du groupe des Galégoïdes et plante de la famille des fabaceae.

Séquençage du génome exprimé en draft complet.

450 millions de paires de bases (3 à 4 fois supérieure à celle d’A. thaliana et équivalente à celle du riz) sur 8 chromosomes.

Diploïde vrai

Nombre de gènes : environ 30 000

Collection de variants naturels et mutants induits Mutagenèse par la méthode de Tilling

Mutagenèse insertionnelle (plus de 200 000 insertions dans M. truncatula ssp. tricycla R108)

Transgenèse (via transformation par Agrobacterium tumefaciens et embryogenèse somatique)

Invalidation de gènes par RNAi

Analyses transcriptomiques

Banques d’ESTs, de cDNA

Bases de données générales : http://www.medicago.org/

http://www.noble.org/

http://www.noble.org/MedicagoHandbook/

http://www.legoo.org/


Bases de données génomiques :

http://mips.gsf.de/proj/plant/jsf/medi/download/index.jsp

http://www.tigr.org/tdb/e2k1/mta1/


Base de données de génomique comparée :

http://www.comparative-legumes.org/


Base de données transcriptomiques :

http://bioinfo.noble.org/gene-atlas/

http://lily.cebitec.uni-bielefeld.de/truncatulix/app

http://www.genxpro.info/science_and_technologies/


Banque de données d’ESTs :

http://compbio.dfci.harvard.edu/tgi/cgi-bin/tgi/gimain.pl?gudb=medicago


Banque de variants naturels :

http://195.220.91.17/legumbase/index.php


Banque de mutants d’insertion :

http://bioinfo4.noble.org/mutant/


Base de données de Tilling :

http://revgenuk.jic.ac.uk/

Sites web : http://medicago.toulouse.inra.fr/ATS/atsindex.html

http://ead.univ-angers.fr/~jaspard/Page2/COURS/9ModulGenFoncVeg/4Arabidopsis/1Arabidopsis.htm

http://www.noble.org/MedicagoHandbook/

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