Zebrafish

Frédéric SOHM
sohm@inaf.cnrs-gif.fr
GIS AMAGEN CNRS INRA , Gif-sur-Yvette

Frédéric ROSA
rosa@biologie.ens.fr
INSERM U784, Paris

Toxicologie
Toxicology

Neurosciences
Neurosciences

Génétique
Genetics

Contrôle génétique de la pigmentation
Genetic control of the pigmentation

Cancerologie
Cancerology

Biologie du développement
Developmental Biology

VIM Infectiologie
Poisson zèbre, Medaka, Porc
http://www6.jouy.inra.fr/vim
Jouy-en-Josas

 

SCRIBE
Poisson zèbre et Médaka
http://w3.rennes.inra.fr/scribe/accueil.htm
Rennes
Patrick Prunet

 

Génétique moléculaire du développement des vertébrés
U 784-INSERM Amatrace
Poisson zèbre
http://www.biologie.ens.fr/bmddzie/
Paris
Frédéric Rosa

 

Biologie du développement
UMR 7009 CNRS/UPMC
Ascidie, Oursin, Poisson zèbre, Clytia hemisphaerica, Pleurobrachia pileus
Equipe Fécondation et contrôle du cycle méiotique, groupe d’Alex McDougall
Equipe BioMarCell : Fécondation et polarisation des embryons d’invertébrés marins, groupe de Christian Sardet
Equipe Spécification des précurseurs embryonnaires, groupe de Hitoyoshi Yasuo
Villefranche-sur-Mer

Le poisson-zèbre est un poisson d’eau douce originaire d’Asie (Inde, Pakistan, Bangladesh, Nepal).On le trouve dans des plans d’eaux stagnantes, les rivières à faible courant et les rizières. Les embryons du poisson zèbre, transparents et se développant en dehors de la mère, ont fait du poisson zèbre un outil puissant pour l’étude du développement des poissons, et par extension, celui des vertébrés. Aujourd’hui, la communauté scientifique l’utilise aussi pour mieux comprendre les mécanismes cellulaires fondamentaux qui s’opèrent lors de la propagation de certaines maladies, telles que le cancer.

De plus, ses excellentes capacités reproductives (ponte en abondance toute l’année), et les conditions d’élevage peu stringentes, en facilitent l’utilisation.

Le poisson zèbre est une espèce ovipare. La ponte des œufs est abondante et la période de reproduction est constante toute l’année. Les œufs sont à soustraire de l’appétit des adultes. Pour cela, des billes ou une grille au fond du bac sont communément utilisées. La femelle pond les œufs, qui, fécondés au passage par le mâle, décantent au fond du bac. Il ne reste plus qu’à retirer les adultes du bac et à pêcher les œufs. L’incubation dure environ 48 heures à 28 C°. Après fécondation, l’œuf va subir une succession de divisions synchrones conduisant à un ensemble de cellules identiques et totipotentes. Au stade de transition mi-blastuléenne, il y a éveil du génome zygotique. La gastrulation va ensuite débuter. Le développement du poisson zèbre est très rapide : seulement 24h après fécondation, le zygote monocellulaire se transforme en embryon de têtard. Le poisson-zèbre adulte mesure 2 à 3 cm. Comme son nom l’indique, il est zébré : il présente cinq bandes bleues horizontales le long du corps. La mise à la reproduction est possible après trois mois pour les plus précoces.

Poisson zèbre appelé aussi Zebrafish, ou Danio rerio

Classification phylogénétique : poisson téléostéen de la famille des cyprinidae

Génome séquencé, 1,5 milliards de paires de bases

Nombre de gènes : env. 26 000, 85% de parenté avec l’homme

Nombreux mutants criblés suite à une mutagenèse intensive

Transgenèse possible par injection dans l’œuf, transfert nucléaires (par de rares laboratoires), transfection des embryons (le suivi de l’activité d’une séquence régulatrice grâce au gène rapporteur GFP est réalisé de façon courante)

Expression ectopique d’un gène par injection de l’ARNm correspondant dans les premiers stades de division.

Etudes de gènes possibles par blocage avec des petites molécules anti-sens de type morpholino.

Etudes de gènes possibles par édition du génome via nucléases (TALE, CRISP-R)

Tests de différentes drogues par simple ajout dans le milieu (les embryons sont perméables aux petites molécules)

Diverses techniques de pointe pour l’exploration fonctionnelle.

http://zfin.org/cgi-bin/webdriver?MIval=aa-ZDB_home.apg

http://www.sanger.ac.uk/Projects/D_rerio/

http://nature.ca/genome/03/c/20/03c_21_f.cfm
http://fr.wikipedia.org/wiki/Poisson_z%C3%A8bre
http://www.aquabase.org/fish/view.php3?id=28
http://ist.inserm.fr/basismedsci/2002/ms_4_2002/sommaire/448.pdf
http://www.ensembl.org/Danio_rerio/Info/StatsTable

Livre :

Biologie du développement de Scott-F Gilbert et Susan-R Singer (Auteurs), Sylvie Rolin et Etienne Brachet (Traducteurs) Editions : De Boeck, 2e édition (13 mai 2004)

Article :

“Etablissement des axes embryonnaires au cours du développement du poisson zèbre”, Bernard Thisse et Christine Thisse, MEDECINE/SCIENCES 2002 ; 18 : 193-204 (disponible
http://ist.inserm.fr/basismedsci/2002/ms_2_2002/sommaire/193_02.pdf)

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