Brachypodium distachyon

Richard SIBOUT
richard.sibout@versailles.inra.fr
Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech, Versailles,

Génomique
Genomics

Génétique

Genetics
 

Ecologie

Ecology
 

Biomatériaux

Biomaterials
 

Biologie évolutive

Evolution
 

Biologie du développement

Developmental Biology
 

Adaptation du végétal à l’environnement
Plant adaptation to environment

Laboratoire de recherche en sciences végétales (LRSV)
Brachypodium distachyon
http://www.lrsv.ups-tlse.fr/

Equipe Méiose et recombinaison (Institut Jean-Pierre Bourgin)
Physcomitrella patens
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/fr/sgap/equipes/meiose/index.htm
Versailles

Mathilde Grelon
 

Equipe biologie du développement dans la cellule végétale :
Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP)
Brachypodium distachyon
http://ibmp.u-strasbg.fr/

Les graminées cultivées sont une des ressources les plus importantes en nutrition humaine. L’amélioration continue de leur culture est un défi majeur, à la fois pour nourrir la population mondiale, mais aussi pour le développement d’énergies renouvelables par la production de nouveaux carburants (bioéthanol). Brachypodium distachyon est un membre de la famille des Poaceae, proche du blé, de l’orge, de l’avoine, du maïs, du riz, du seigle, du sorgho et du millet. C’est une herbe sauvage annuelle endémique des régions de la Méditerranée et du Moyen-Orient. Elle est un excellent système modèle pour la recherche sur les herbes tempérées, de par notamment son petit génome diploïde (~270 Mbp), dont la séquence a été publiée en 2010, sa petite taille, son autogamie, un cycle de vie court, des conditions de croissance simples, et un système de transformation efficace. La position phylogénétique clé de cette herbe, ainsi que la publication de la séquence de son génome, renforcent d’une part ce modèle en tant qu’outil pour la génomique fonctionnelle, mais vont aussi permettre pour la première fois des analyses comparées de génomes d’autres espèces d’herbes cultivées économiquement importantes.

Brachypodium distachyon est autogame mais peut-être croisée et a un cycle de vie annuel court. Le temps de génération est de 8 semaines environ. Les conditions de croissance sont très peu stringentes. La petite taille des accessions est un autre avantage pour le rendement de la culture car un petit espace peut accueillir un grand nombre de spécimens.

Brachypodium distachyon

Classification phylogénétique : plante (division Magnoliophyta) de la famille des Poaceae.

La tribu Brachypodium est au sein de la sous-famille des Pooideae, le groupe frère de quatre tribus d’herbes d’importance majeure en nutrition : les Triticeae (dont le blé), Aveneae (dont l’avoine), Poeae et les Bromeae.

Génome séquencé (2010)

272 millions de paires de bases sur 5 paires de chromosomes (petit génome pour une espèce d’herbe)

Nombre de gènes prédits : 25 532 loci codant des protéines

Transformation des plantes médiée par Agrobacterium tumefaciens aisée et efficace TILLING

RNAi

Recombinant Inbred Lines, QTL

Collections de marqueurs génétiques (dont SSR-_simple sequence repeats-)

Librairies de BAC

Collections de graines (« germplasm »)

Collections de mutants

Collections de microarrays, cDNA, EST

Bases de données génétiques : The Brachypodium distachyon Information Resource :

http://www.brachypodium.org/

The Brachypodium distachyon genome browser and annotation database :

http://www.brachybase.org

Understanding genes in Brachypodium :

http://www.brachytag.org/

Base de données de génétique comparative :

http://www.phytozome.net/ Brachypodium genome browser :

http://www.modelcrop.org

Collection de mutants :

http://brachypodium.pw.usda.gov

http://www.brachytag.org

Collection de graines (“germplasm”)

http://www.ars-grin.gov/

Livre : Chapitre “Brachypodium distachyon, a New Model for the Triticeae”, publié dans Genetics and Genomics of the Triticeae”, edsVogel and Bragg, Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, 2009, (disponible http://link.springer.com/chapter/10.1007%2F978-0-387-77489-3_16)

Articles :

« Brachypodium as a model for the grasses: Today and the future », Brkljacic et. al., Plant Physiol., 2011 (disponible http://www.plantphysiol.org/content/early/2011/07/19/pp.111.179531.long)

« Brachypodium distachyon genomics for sustainable food and fuel production » Bevan et. al., Curr Opin Biotechnol. 2010 (disponible http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20362425)

« Brachypodium distachyon: making hay with a wild grass », Opanowicz et. al., Trends Plant Sci., 2008 (disponible http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18343709)

male-enhancement-pills   penis-enlargement-medicine   best-penis-enlargement-pills   male-enhancement-pills-that-work   penis-pills   best-erection-pills   penis-enlarger   penis-enlargment   best-sex-drugs   evermax-pill   penis-enlargements   hard-on-pills-that-work   enhanced-male-pills   male enhancement   penis extender   best male enhancement pills   penis enlargement medicine   best male enhancement   penis stretcher   penis enlargement pills   extenze reviews   penis extenders   sex pills   how to produce more sperm   extenze review   extenze male enhancement   male enhancement pills that work   bathmate results   male enlargement pills   male extra   extenze pills   how to increase semen volume   increase sperm volume   penis pills   volume pills   male enhancement pills that work fast   increase semen volume   bathmate before and after   best penis enlargement pills   male enhancement pill   penis enhancement   penis pump before and after   how to increase sperm volume   best budget penis pumps   enhanced male   best erection pills   bathmate review   best penis pumps   penis traction   how to produce more cum   male enhancement products   3 ways to increase seminal fluid   male enhancement pills over the counter   penis pump results   increase ejaculate   best sex pills   male enhancement reviews   how to produce more semen   dick pills   sex pills for men   penis enlargement pill   how to increase ejaculate volume   how to increase ejaculate   extenze side effects   huge ejaculation   penis enlargement pump   water penis pump   male enhancement supplements   do penis enlargement pills work   increase semen   bath mate   penis pump reviews   penis growth pills   best male enhancement pill   bathmate routine   size genetics   male supplements   male enlargement   male extra reviews   the best male enhancement pills over the counter   how fast does extenze work   how to ejaculate more   extenze results   penile extender   bathmate x30   max performer   best penis extender   bathmate reviews   semen volume   extenze extended release   penis pumps   dick enlargement   how long does it take for extenze to work   dick pumps   penile traction   big loads   best male enhancement pills that work   increase sperm volume pills   extenze pill   best male enlargement pills   male sex pills   penis strecher   home made penis pump   dick extender   cum pills   natural ways to increase seminal fluid   best penis enlargement   penis pump before after   penile traction device   best over the counter male enhancement   over the counter male enhancement pills   male extra review   vigrx plus review   does bathmate work   extenze directions   best penis   penis enlargement pills that work   volume pill   sex pill   male enhancer   increase cum   extenze ingredients   semen volumizer   increase semen production   do male enhancement pills work   enhancement pills   vigrx pills   penis enlargment pills   stamina pills   are penis pumps safe   cock pumps   darren jackson   best natural male enhancement   penis stretchers   best penis enlargement medicine   male enhancement drugs   how to increase sperm thickness   where to buy vigrx plus   best sex pills over the counter   sexual enhancement pills   increase ejaculation   increase cum volume   sexual enhancement   penis enhancers   hard on pills that work   enhancement male pill   extenze ingridients   extenze befor and after   malextra pills   extenz results   penis enlargements pumps   extenze ingredience   male enhancement pills   penis enlargement medicines   volumepills review   penis extender result   extenze ingredient   penis pump review   how to increase ejaculation volume   cock extenders   penis enlargement devices   vigrex tablets   how to increase semen amount   male performance pills   bathmate hydro   how to increase cum load   penis extenders reviews   best male enhancers   how to increase semen production   how to produce more seminal fluid   bathmate x40   male drive max   increase cum load   bathmate before after   volume increaser   produce more sperm   best male enhancement pills over the counter   max load pills   volume pills review   natural male enhancement herbs   delay pills for men last longer   cock stretcher   enhanced male pil   male enhancement pills free trials   penispumps   penis enlargement device   male sexual enhancement   extend pills   sex enhancement pills   all natural male enhancement   long sex pill   best male supplement   extenze maximum strength   do penis pills work   produce more semen   how to produce more seminal fluid naturally   increasing semen volume   penis extenders review   how to increase semen   best male enhancement pills 2019   male enhancement pills reviews   increase ejaculate volume   bathmate hydro pump   increase seminal fluid   natural male enhancement pills   hydro penis pump   vigrx reviews   do penis extenders work   over the counter male enhancement   male enhancements   top male enhancement pills   penis traction device   bathmate pump